成都小程序定制开发：如何为地板企业打造专属网站？

地板网站建设,成都小程序系统定制开发,上海做无创DNA医院网站,网站建设交流发言稿MMPBSA计算–基于李继存老师gmx_mmpbsa脚本 前期准备 软件安装 安装gromacs, 可以查阅 我的blogGromacs-2022 GPU-CUDA加速版 unbantu 安装 apbs, sudo apt install apbs 安装 gawk, sudo apt install gawk MD模拟好的文件 我们以研究蛋白小分子动态相互作用-III(蛋白配体…MMPBSA计算–基于李继存老师gmx_mmpbsa脚本 前期准备 软件安装 安装gromacs, 可以查阅 我的blogGromacs-2022 GPU-CUDA加速版 unbantu 安装 apbs, sudo apt install apbs 安装 gawk, sudo apt install gawk MD模拟好的文件 我们以研究蛋白小分子动态相互作用-III(蛋白配体复合物 GROMACS)模拟好的文件为例子 需要准备如下文件 脚本执行 MD 做完后需要修复轨迹 gmx trjconv -s md_0_10.tpr -f md_0_10.xtc -o md_0_10_center.xtc -center -pbc mol -ur compact采集最后5ns的模拟数据 gmx trjconv -f md_0_10_center.xtc -o trj_5-10ns.xtc -b 5000 -e 10000检查轨迹路径 gmx check -f trj_5-10ns.xtc检查index.ndx 配体的索引只能是一个多的必须删除 下载 gmx_mmpbsa.bash网址https://github.com/Jerkwin/gmxtools/blob/master/gmx_mmpbsa/gmx_mmpbsa.bsh 修改文件 修改为 执行文件 bash gmx_mmpbsa.bash最终结果 结果结合力非常强